Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cxcl2P10889 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cxcl2P10889 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cxcl2P10889 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cxcl2P10889 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms