Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms