Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04214 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P04214 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04214 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms