Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms