Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnc1O35914 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnc1O35914 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms