Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc1a6O35544 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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