Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Fam240aJ3QNP9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Fam240aJ3QNP9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fam240aJ3QNP9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fam240aJ3QNP9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fam240aJ3QNP9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Fam240aJ3QNP9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Fam240aJ3QNP9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam240aJ3QNP9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam240aJ3QNP9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam240aJ3QNP9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam240aJ3QNP9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam240aJ3QNP9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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