Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm17555F6U8B9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17555F6U8B9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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