Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm10477F6SW83 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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