Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9887F6RFI0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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