Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rnf169E9Q7F2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf169E9Q7F2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf169E9Q7F2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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