Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3002E9PW72 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms