Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim30bE9PVL6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms