Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms