Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms