Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms