Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf3B2RQG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms