Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms