Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem238A9JSM3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms