Protein–RNA interactions for Protein: A2A8N0

Gm13084, Predicted gene 13084, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13084A2A8N0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm13084A2A8N0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm13084A2A8N0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms