Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5114W4VSN8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm5114W4VSN8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm5114W4VSN8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5114W4VSN8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms