Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac6Q9Z2V5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac6Q9Z2V5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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