Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Knop1Q9Z2Q2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knop1Q9Z2Q2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms