Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Thbs4Q9Z1T2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Thbs4Q9Z1T2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs4Q9Z1T2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Thbs4Q9Z1T2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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