Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Ap3b1Q9Z1T1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ap3b1Q9Z1T1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ap3b1Q9Z1T1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms