Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sh3bp5Q9Z131 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sh3bp5Q9Z131 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bp5Q9Z131 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sh3bp5Q9Z131 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bp5Q9Z131 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms