Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pard6aQ9Z101 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pard6aQ9Z101 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pard6aQ9Z101 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms