Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skp2Q9Z0Z3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skp2Q9Z0Z3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp2Q9Z0Z3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp2Q9Z0Z3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms