Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NgfrQ9Z0W1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NgfrQ9Z0W1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NgfrQ9Z0W1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NgfrQ9Z0W1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms