Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb6Q9Z0T9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb6Q9Z0T9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms