Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Extl3Q9WVL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Extl3Q9WVL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Extl3Q9WVL6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Extl3Q9WVL6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Extl3Q9WVL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Extl3Q9WVL6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Extl3Q9WVL6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Extl3Q9WVL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms