Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cyp46a1Q9WVK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cyp46a1Q9WVK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cyp46a1Q9WVK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cyp46a1Q9WVK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cyp46a1Q9WVK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cyp46a1Q9WVK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Cyp46a1Q9WVK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cyp46a1Q9WVK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,4 ms