Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx1Q9WV80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx1Q9WV80 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx1Q9WV80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx1Q9WV80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms