Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUQ2

Preb, Prolactin regulatory element-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrebQ9WUQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrebQ9WUQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrebQ9WUQ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrebQ9WUQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrebQ9WUQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrebQ9WUQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrebQ9WUQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrebQ9WUQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrebQ9WUQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms