Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cul1Q9WTX6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul1Q9WTX6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul1Q9WTX6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms