Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp18Q9WTV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp18Q9WTV6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp18Q9WTV6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp18Q9WTV6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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