Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vax2Q9WTP9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vax2Q9WTP9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms