Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sorbs3Q9R1Z8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sorbs3Q9R1Z8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sorbs3Q9R1Z8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms