Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lamc3Q9R0B6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lamc3Q9R0B6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lamc3Q9R0B6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lamc3Q9R0B6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lamc3Q9R0B6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms