Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms