Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp11cQ9QZW0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp11cQ9QZW0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp11cQ9QZW0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms