Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf4Q9QZS2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf4Q9QZS2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf4Q9QZS2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf4Q9QZS2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms