Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai3Q9QY31 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai3Q9QY31 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms