Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf3Q9QXK7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cpsf3Q9QXK7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cpsf3Q9QXK7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf3Q9QXK7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms