Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trp53inp1Q9QXE4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trp53inp1Q9QXE4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trp53inp1Q9QXE4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms