Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Limd1Q9QXD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Limd1Q9QXD8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms