Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim44Q9QXA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim44Q9QXA7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms