Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms