Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aldh9a1Q9JLJ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh9a1Q9JLJ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms