Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tgm1Q9JLF6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgm1Q9JLF6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Tgm1Q9JLF6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tgm1Q9JLF6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Tgm1Q9JLF6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Tgm1Q9JLF6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Tgm1Q9JLF6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Tgm1Q9JLF6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgm1Q9JLF6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms